Die Immobiliengesellschaft B SA (nachfolgend "SI" oder "SI B AG") mit Sitz in Genf befand sich seit dem 14. März 1977 im Besitz eines kanadischen Staatsangehörigen, der aus dem Irak stammte und in London ansässig war. Gemäss der Bilanz der SI per 15. November 2013 hatte diese als Hauptvermögenswert eine in Genf gelegene Liegenschaft mit einem Wert von CHF 5'135'326.50.

Gemäss Aktienkaufvertrag vom 4. Dezember 2013 erwarb die A AG mit Sitz in Genf das gesamte Aktienkapital der SI. Der von den Parteien vereinbarte Verkaufspreis wurde auf CHF 6'300'000 festgelegt. Zusätzlich zum Kaufpreis verpflichtete sich die A AG, die Schulden des veräussernden Aktionärs gegenüber der SI in Höhe von CHF 993'419 zu übernehmen. Der Verkaufspreis der SI belief sich somit schliesslich auf insgesamt CHF 7'293'419.

Am 4. Dezember 2013, also am Tag der Unterzeichnung des Aktienkaufvertrags, verkaufte die A AG die von der SI gehaltene Liegenschaft für einen Preis von CHF 18'200'000 an eine Stiftung. Infolge dieser Transaktion verbuchte die SI einen Gewinn von CHF 12'609'673.50 und beschloss dann anlässlich der ordentlichen Generalversammlung vom 23. Oktober 2015, eine Dividende von CHF 9'...